Согласно стандартных настроек всякой сканируемой страничке присваивается номер, который больше на одну единицу самого большого номера изображения в активном пакете файн ридер.

У вас есть возможность установить номер добавляемой странички вручную. Для сего:

На закладке Сканирование/Открытие выберите Запрашивать номер страничек в момент добавления в пакет.

В момент сканирования стопки сортированных поочередно двусторонних страниц:

Пункт первый. Выберите на закладке Сканирование/Открытие запросить номер перед добавлением в пакет.

Пункт второй. В диалоговом окне Номер странички укажите номер странички, с коей берет начало сканирование и нужно выбрать опцию чрез одну в поле Нумерация страничек.